幾乎所有胎兒的內臟器官， 在出生前都會持續不斷的成長變化， 因此並非在早期檢查時， 為正常狀況的器官， 就能保證在出生後也一定正常。 也因為超音波受限於媽媽肚皮及子宮的阻擋， 無法調整胎兒的姿勢及位置， 無法獲得某些角度的影像。 孫三源院長提出以下幾項， 因胎兒成長狀況而造成超音波檢查有所限制的情況：
1、水腦：有許多水腦或水腎的狀況， 都會到了懷孕後期才逐漸產生。
2、全盲：胎兒在子宮內因為沒有光線的刺激， 因此不會睜開眼睛， 所以無法診斷出先天全盲或小眼症的狀況。
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3、聽力：在胎兒5～6個月大時， 聽力已有發育， 但目前沒有任何的方式可以得知， 胎兒是否有先天性聽障的問題。
4、先天心臟病：心臟的心房中隔(即卵圓孔)， 以及動靜脈導管， 都是在出生後才會逐漸關閉， 雖然是在出生便可輕易診斷出的心臟病， 卻無法在出生前就得知。
5、腸胃道阻塞：腸胃道的阻塞病變， 極少數會出現在懷孕24周之前， 因為胎兒在懷孕前期， 很少大口的吞進羊水。
6、肢(指、趾)端異常：像是手腳內翻或外翻、多指(趾)、並指或指節缺失等異常狀況， 也因為胎兒常處於握拳狀態， 幾乎無法由超音波確切診斷。
7、侏儒症：有部分的侏儒症狀， 無法在早期診斷出來。 因為胎兒在6～7個月大的時候， 就會逐漸停止骨頭的發育生長。
8、先天性代謝異常：絕大部分的生化代謝異常疾病，
