我們通常遇到過敏的情況, 其實上是我們自身的細胞與外界接觸有了反應。 同T細胞一樣, B細胞在成熟過程中也要清除能同自身反應的那部分細胞。
在骨髓中, 一旦B細胞的抗原受體同自身抗原相結合, B細胞就會失活死亡。 所以具有自身抗原受體的B細胞在成熟階段就被清除了。 不幸的是, 在體內還存在一些骨髓中沒有的自身抗原。 可以想像, 如果具有與這些自身抗原受體的B細胞成熟後, 對自己的細胞發動進攻, 倒戈相向, 那不是非常危險嗎?如果同自身抗原結合, 活化之後又產生了針對自己的抗體,
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實際上根本不用擔心, 這種情況幾乎是不會發生的。 因為B細胞要分裂、分化形成抗體產生細胞, 必須有輔助T細胞的協助, 所以B細胞即使能同自身抗原反應, 若沒有相應的輔助T細胞, B細胞也不能產生抗體。 我們體內存在著巧妙控制淋岜細胞(B細胞及T細胞)不與自身抗原反應的機制, 維持著避免自身免疫應答的狀態, 我們將這種狀態稱為“免疫耐受”。 此外, 在某些情況下, 機體對外來抗原也會產生免疫耐受。 例如剛出生的嬰兒, 免疫應答能力很低, 雖然抗體接觸到抗原, -卻也有可能對抗原出現免疫耐受的現象。