1、[腦積水] 有許多腦積水或腎積水的情況， 都會到了懷孕後期才逐漸產生。
2、[全盲] 胎兒在子宮內因為沒有光線的刺激， 因此不會睜開眼睛， 所以無法診斷出先天全盲或小眼症的狀況。
3、[聽力] 在胎兒5～6個月大時， 聽力已有發育， 但目前沒有任何的檢查方式可以得知胎兒是否有先天性聽障的問題。
4、[先天性心臟病] 心臟的心房中隔（即卵圓孔）及動靜脈導管都是在出生後才會逐漸關閉， 在出生時可輕易診斷出的心臟病， 卻無法在出生前就得知。
5、[腸胃道阻塞]腸胃道的阻塞病變極少會出現在懷孕24周之前， 因為胎兒在懷孕前期通常很少大口地吞進羊水。
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6、[肢（指、趾）端異常]像是手腳內翻或外翻、多指（趾）、並指或指節缺失等異常狀況， 也因為胎兒常處於握拳狀態而幾乎無法由超聲波確切診斷。
7、[侏儒症]有部分的侏儒症無法在早期診斷出來。 因為胎兒在6～7個月大的時候， 骨頭的發育生長就會逐漸停止。
8、[先天性]代謝異常]絕大部分的生化代謝異常疾病， 如黏多醣症， 要等到寶寶出生進食後， 才會逐漸發病， 也因此許多致死性的生化代謝異常在產前無法辨認， 除非媽媽已生過類似疾病的寶寶。
