正常育齡婦女的基礎體溫與月經周期一樣， 呈周期性變化， 這種體溫變化與排卵有關。
女性月經周期以月經見紅第一天為周期的開始， 周期的長短因人而異， 約為21-35天不等， 平均約為28天， 其中又以排卵日為分隔， 分為排卵前的濾泡期， 與排卵后的黃體期。 濾泡期長短不一定， 但黃體期固定約為14天上下兩天。 排卵后次日， 因卵巢形成黃體， 分泌黃體素會使體溫上升攝氏0。 6度左右， 而使體溫呈現高低兩相變化。 高溫期約持續12-16天（平均14天）。
1、若無懷孕， 黃體萎縮停止分泌黃體素， 體溫下降， 回到基本線， 月經來潮。
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2、若是已經懷孕， 因黃體受到胚胎分泌荷爾蒙支持， 繼續分泌黃體素， 體溫持續高溫。
3、若卵巢功能不良， 沒有排卵也沒有黃體形成， 體溫將持續低溫。
