清潔完奶瓶之後， 就要進行消毒了， 一般嬰兒奶瓶的消毒方式， 可以分為煮沸法及蒸汽鍋消毒法， 其消毒方式及步驟如下：
A.煮沸消毒法
1、準備一個不銹鋼的煮鍋， 裡面裝滿了冷水， 水的深度， 要能完全覆蓋所有已經清洗過的餵奶用具。 (不銹鋼鍋須消毒奶瓶專用， 不可與家中其他烹調食物混用)
2、如果是玻璃的奶瓶可與冷水一起放入鍋中， 等水燒開後5～10分鐘再放入奶嘴、瓶蓋等塑膠製品， 蓋上鍋蓋再煮3～5分鐘後關火， 等到水稍涼後， 再用消毒過的奶瓶夾取出奶嘴、瓶蓋， 待幹了之後再套回奶瓶上備用。 若是塑膠的奶瓶，
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3、要提醒的是， 塑膠製成的食具， 都不宜煮久， 所以建議在水滾後再放入， 煮3～5分鐘即可， 否則很容易變質。 也可以注意奶瓶上的耐溫標示， 如果不耐高溫最好使用蒸汽鍋消毒。
B.蒸氣鍋消毒法
目前市面上有多種功能、品牌的電動蒸汽鍋， 家長可以依照自己的需要來選擇， 消毒的方式只靄要遵照說明書操作， 就可以達到消毒餵奶用具的目的。 但需注意的是， 使用蒸汽鍋消毒前， 仍先將所有的奶瓶、奶嘴、奶瓶蓋等物品徹底清洗乾淨， 然後再一起放入， 按上開關， 待其消毒完畢，
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寶寶的奶瓶消毒完成後， 應將留在瓶身內的水徹底倒淨， 之後倒扣瀝幹， 並以消毒過的奶瓶夾， 將消毒過的奶瓶、奶嘴、奶瓶蓋等， 夾放置通風、乾淨處放涼備用， 並蓋上紗布或蓋子。 此外， 若於消毒24小時後仍舊沒有使用奶瓶， 就需重新進行一次消毒工作， 以免細菌滋生。 寶寶每次喝完奶後， 媽媽可以先用奶瓶刷將奶瓶清洗乾淨， 搜集放置於奶瓶架上晾乾， 待累積到一定的數量或消毒鍋可容納的大小， 再一起進行消毒工作。 所以媽媽一次必須準備很多支奶瓶， 才足以應付寶寶一天所需。
