子宮內膜薄大多是由於子宮內膜基底層破壞而引起的, 常發生於人工流產術中過度刮宮引起的子宮內膜基底層損傷和粘連, 粘連可使宮腔、宮頸內口、宮頸管或者上述多處部位部分或者全部阻塞, 從而引起子宮內膜不應性或者阻塞性閉經。 子宮內膜結核也可破壞子宮內膜引起閉經, 宮內節育環引起宮內感染也可發生閉經。
這種情況下進行治療, 需要進行手術分解宮頸及宮腔粘連。 在有宮腔鏡的情況下, 醫護人員機械性切割或者鐳射切割粘連帶;沒有宮腔鏡的話則只能採取傳統的宮頸擴張器和刮宮術分解粘連,
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有生育要求或者B超檢查提示子宮內膜過薄的患者還必須採用大劑量雌激素治療。 常用藥物為妊馬雌酮2.5mg, 每日一次, 需連服21天, 在第三周開始加用醋酸甲羥孕酮, 每日10mg, 連續7天。 兩種藥物同時停藥後或出現藥物撤退性出血, 如果撤退性出血量少, 可以重複上述方案3-6次, 直到撤退性出血量接近或者達到既往月經量。