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在懷孕中如果營養不好會造成胎兒發育不良， 其中最常聽到與胎兒畸形有關的營養素就是葉酸， 葉酸是形成dna及蛋白質很重要的原素， 若懷孕時缺乏葉酸， 容易造成胎兒神經管的缺陷， 如無腦兒或脊柱裂， 並且兔唇、顎裂的機會也升高。
一般會建議想要懷孕的人， 在孕前可每天服用葉酸0.4毫克， 對於曾發生過這種缺陷胎兒或有家族史的人， 在懷孕前二個月及懷孕後一個月， 每天可服用4毫克葉酸， 有些國家會在榖物或麵粉中添加葉酸以為預防。
然而有些營養素補充太多也不好。 如維他命a， 孕婦若每天服用超過一萬單位(i.u.)的維他命a則有1/4機會造成胎兒畸形，
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維他命d補充過多如每日超過15毫克容易造成軟組織的鈣化， 碘過多會造成甲狀腺腫及功能亢進；如果鋅的補充超過每日45毫克， 容易造成早產；氯補充太多也容易傷害胎兒的牙齒。
鐵劑的補充也要謹慎。 我們發現， 孕婦貧血的比例高， 所以很多人在懷孕中有補充鐵劑的習慣， 雖然沒有證據顯示補充鐵劑會造成胎兒畸形， 但有人認為， 血色素過高容易造成孕婦高血壓、新生兒死亡、低體重及早產， 因此， 適當的補充鐵劑也很重要。 一般建議在懷孕3個月以上再補充較為適宜，
