疫苗可以增加人體免疫力， 分為很多種類， 包括類毒素疫苗、滅活病毒疫苗、免疫球蛋白製劑、病毒和細菌疫苗。 通常認為， 除活病毒或活細菌疫苗以外， 其他疫苗對妊娠女性都是安全的。 儘管如此， 由於不能確定疫苗對胎兒發育沒有風險， 所以如果不需要立即接種， 還是建議在懷孕12周以後再接種。
在免疫接種麻疹、風疹、腮腺炎聯合減毒活疫苗、水痘疫苗或者黃熱病疫苗後的1個月內妊娠， 尚未發生畸形胎兒的報導。 因此， 如果在不知道懷孕情況下接種了這些疫苗， 沒有必要選擇流產， 也沒有必要在接種類毒素、滅活病毒疫苗或免疫球蛋白製劑後延遲受孕。
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美國推薦所有妊娠女性（不論孕周多少）都應在流感高發季節（10月到次年5月）接種流感疫苗。 如果孕婦併發其他疾病（如哮喘、心臟病）， 感染流感時會使併發症加重， 建議在流感高發季之前接種疫苗。 針劑流感疫苗可用於妊娠任何時候， 減毒活疫苗為鼻噴霧劑， 不建議孕婦使用。 流感疫苗接種後， 2周時間機體才會建立好保護性抗體， 對孕婦及出生6個月以內的嬰兒均有保護作用。
