第一重：毒副作用。 “是藥三分毒”， 應嚴格遵照醫囑服藥， 切不可盼複心切， 擅自加大抗菌藥物(包括抗生素和人工合成的抗菌藥， 如氟呱酸)的藥量， 否則很可能損傷神經系統、腎臟、血液系統。 尤其是對肝腎功能出現異常的患者， 更要慎重。 需要強調的是， 一般來說， 輕度上呼吸道感染選用口服抗生素即可， 但很多人卻選擇了靜脈輸液， 這無形中也增加了出現副作用的風險。
第二重：過敏反應。 多發生在具有特異性體質的人身上， 其表現以過敏性休克最為嚴重。 青黴素、鏈黴素都可能引發， 其中青黴素最常見也更為嚴重。
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第三重：二重感染。 當用抗菌藥物抑制或殺死敏感的細菌後， 有些不敏感的細菌或黴菌卻繼續生長繁殖， 造成新的感染， 這就是“二重感染”。 這在長期濫用抗菌藥物的病人中很多見。 因此治療困難， 病死率高。
第四重：耐藥。 大量使用抗生素無疑是對致病菌抗藥能力的“鍛煉”， 在絕大多數普通細菌被殺滅的同時， 原先並不佔優勢的具有抗藥性的致病菌卻存留了下來， 並大量繁衍。 而且由於藥物長期刺激， 使一部分致病菌產生變異、成為耐藥菌株。 這種耐藥性既會被其他細菌所獲得， 也會遺傳給下一代。 “超級細菌”很大程度上就是抗菌藥物濫用催生出來的。 如果這種情況繼續惡化下去，
