病因和病理機制尚不明確， 可能和以下原因有關。
1、遺傳因素：口吃患者家族發病率可達36%～55%， 故有人認為與遺傳因素有關， 可能為單基因遺傳。 也有人發現口吃患者及親屬中左利手多見， 認為口吃與大腦優勢側有關。
2、軀體因素：較多兒童圍產期或嬰幼兒期曾受到有害因素作用， 如胎兒期母體患妊娠毒血症、出血或軀體性疾病， 或發育過程中患某些傳染病使神經系統功能弱化， 言語功能受累而致口吃。
3、精神因素：兒童口吃往往發生在急性或遷延性精神創傷之後， 因而不少學說認為精神因素可能為口吃的重要發病原因。
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當幼兒聽了可怕的故事、看了可怕的影片而受到驚嚇， 或是由於家庭不和睦、家長對孩子管教方式不當， 態度粗暴導致孩子精神緊張、壓抑都會致使孩子產生口吃。 另外， 成人不能正確對待幼兒學語階段的不流暢現象， 便會使幼兒說話過分緊張， 更加張口結舌。
4、其它因素：有的學齡前兒童罹患口吃是因模仿所致。 小孩子喜歡模仿， 常常因為看到別人口吃感到有意思而加以模仿， 從而感染上口吃。
有資料則根據腦電圖、發音肌肌電圖和氟呱啶醇臨床療效。 推斷口吃可能與邊緣系統和網狀結構複合體活動增強、發音肌功能不協調、和基底節存在生化障礙等因素有關， 但尚待臨床進一步論證。
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總之， 口吃可能是生理與心理多種因素綜合作用的結果。
