小兒口腔黏膜柔嫩, 血管豐富, 容易損傷出血, 故忌用毛巾擦口腔黏膜, 以免損傷口腔黏膜而導致感染。
新生兒唾液腺發育不完善, 唾液分泌量小, 隨年齡增長唾液發育趨于完善。 56個月以后的嬰兒, 由于出牙更增加唾液分泌, 且小兒尚未形成吞咽唾液的習慣,
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小兒胃的位置比較水平, 待小兒能站立和行走后, 胃的位置逐漸變為垂直。 嬰兒賁門肌肉較松弛, 幽門肌肉則較發達, 故兒時較易發生嘔吐, 尤其于哺乳時吞人較多空氣, 或吃奶量過多及哺乳后立即置于平臥位時。 小兒胃容量小, 食物通過胃的時間比成人快, 每次食量不如成人大, 故每日飲食次數需比成人多。 嬰兒胃排空時間與食物種類有關, 母乳為23小時, 牛乳為34小時, 水僅為1~1。 5小時。 因此嬰兒一般3小時左右喂一次奶。
嬰兒腸的總長度相對較成人長, 且小腸長度占大腸長度的比例較高。
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小兒消化系統以外疾病, 如感冒、肺炎和其他傳染病, 均容易影響小兒消化功能, 導致食欲不佳、嘔吐或腹瀉。 有時, 這些表現在原發病痊愈一段時間后才能恢復。