許多藥物在一起應用, 或者可以互相抵消或降低各自的療效, 或者能增加各自的不良反應。 一般分為2種配伍禁忌。
避免藥理性配伍禁忌:很多藥物的藥理作用是互相對抗的, 如中樞神經興奮劑和中樞抑制劑、升壓藥與降壓藥、血管緊張劑與血管擴張劑、瀉藥與止瀉藥、擴瞳劑與縮瞳劑、抗凝血劑與止血藥等。 另外, 兩種具有槲司作用的藥物配伍後往往也會產生不良後果。 如阿的平與伯氨喹啉同為抗瘧原蟲藥物, 但兩者配伍後, 前者使後者從血中排除的速率減慢, 從而增加其毒性反應。
避免理化性配伍禁忌:藥物可有酸性、鹼性之分,