間質性肺炎大多由於病毒所致, 主要為腺病毒、呼吸道合胞病毒, 流感病毒、副流感病毒、麻疹病毒等。 其中以腺病毒和流感病毒引起的間質性肺炎較多見, 也較嚴重, 常形成壞死性支氣管炎及支氣管肺炎, 病程遷延易演變為慢性肺炎。
肺炎支原體也能引起間質性肺炎。 支原體經呼吸道侵入後, 主要侵犯細支氣管和支氣管周圍組織, 由於無破壞性病變,
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過敏性肺炎, 是由於吸入含有真菌孢子、細菌產物、動物蛋白質或有機物塵埃所引起的非哮喘性變應性肺疾患, 以彌漫性肺間質炎為病理特徵, 能痊癒, 不留後遺症。
比較少見的, 如肺炎鏈球菌肺炎, 金黃色葡萄球菌肺炎的併發症, 化膿性炎症擴展到間質組織, 引起化膿性間質性肺炎。 若炎症繼續發展可發生肺膿腫、膿胸等;若病變停止發展, 則轉向恢復痊癒, 但也可形成慢性間質性肺炎。