這是因為懷孕中大量的黃體素會抑制膀胱迫使尿肌收縮， 容易造成膀胱輸尿管尿液逆流， 導致腎臟水腫；也會造成腎盂、腎小管、輸尿管鬆弛。 而增大的子宮又會壓迫膀胱、輸尿管， 使膀胱不易排空尿液， 造成尿液滯留。 給予病菌感染、滋生的機會。
另外， 輸尿管受到增大的子宮壓迫， 形同輸尿管阻塞， 更易導致輸尿管擴張， 因此腹部出力時， 如咳嗽、跑步、提重物， 受力增加的膀胱內壓會推擠尿液， 使尿液順著擴張的輸尿管逆流而上。 此時， 若尿液受到病菌感染， 又無法完全將感染的尿液排空， 病菌便由下泌尿道感染蔓延至上泌尿道。
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當尿液培養發現有致病菌種， 但還未造成任何不適症狀， 就稱為無症狀菌尿症。 如果細菌侵犯到尿道， 則會造成尿道炎， 會有尿疼痛或燒灼感以及尿頻的現象。 如果再往上侵犯到膀胱， 就會變成膀胱炎， 除了上述症候外， 往往還會出現血尿或下腹痛的情況。 如果沒有及時給予治療， 還可能變成急性腎盂腎炎， 症狀與膀胱炎很類似， 但還會伴隨有發燒、畏寒、下腰背酸痛、噁心、嘔吐等症狀。 准媽媽一旦有急性腎盂腎炎， 就會增加胎兒早產、體重過輕、生長遲緩的幾率。
如果是無症狀菌尿症、尿道炎、膀胱炎， 通常只需門診治療， 不需要住院。 若一旦出現併發症， 如高熱、寒戰、噁心、嘔吐或背痛時， 醫師可能就會建議入院治療。
