扁桃體是咽部最大的淋巴組織。 在兒童時期, 它是個活躍的免疫器官, 含有各個發育階段的淋巴細胞, 如T細胞、B細胞、吞噬細胞等。 所以它既具有體液免疫作用, 產生各種免疫球蛋白, 也有一定的細胞免疫作用。
扁桃體產生的免疫球蛋白IgA免疫力很強, 可抑制細菌對呼吸道黏膜的粘附, 並可抑制細菌的生長和擴散, 對病毒也有中和與抑制作用。
IgA還可通過補體的活化, 增強吞噬細胞的功能。 這些在兩歲至五歲時表現最為活躍。
從免疫的觀點來看, 由於其對身體的免疫作用, 不應隨便將扁桃體摘除。 兒童扁桃體肥大是正常生理現象,
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如果扁桃體炎反復發作, 妨礙呼吸和吞咽, 引起風濕及腎炎等疾病時, 應及時切除。 一般兒童扁桃體切除術應在四歲以後進行, 而且要等炎症消退後兩周至三周切除比較適宜。 但若發作過於頻繁, 不能久等, 可考慮在發作消退後數天施行手術。