所有的疫苗都有其副作用, 只是發生率和嚴重度各不相同。 目前所用的疫苗之中, B型肝炎疫苗是副作用最小的一種;副作用最大的是百日咳疫苗, 有相當高的比例會有發燒與其它反應。
如果接種疫苗以後出現了某種症狀, 我們要判斷是否與疫苗有關, 首先要考慮此種疫苗是否常引起這種反應, 例如, 接種B型肝炎疫苗很少引起這種全身性反應, 此時就必須考慮小孩子是不是得了其它疾病, 而不要馬上將一切歸咎於疫苗。 其次, 我們必須考慮到症狀發作的時間。 一般而言, 非活性疫苗的反應大多是在接種疫苗一、二天以內發生;活性疫苗則因為需要一段潛伏期才會出現症狀,