藥物具有治療作用， 但也有損害健康的毒害作用， 醫學上將藥物的毒害作用稱藥物的不良反應。 藥物對新生兒的不良反應與成人相比不完全相同。 為使藥物發揮最大療效， 減少或避免不良反應， 現將常用藥物對新生兒的不良反應介紹如下。
(1)神經系統反應。 四環素、腎上腺素、維生素A、氨硫脲等較易沉積於骨組織中， 阻礙骨骼的發育， 甚至引起腦水腫；腎上腺皮質激素可引起新生兒手足抽搐症；鏈黴素、慶大黴素、卡那黴素、多黏菌素B等易損傷新生兒酌聽神經及腎功能。
(2)心臟血管系統反應。 新生兒強心藥——洋地黃若用量偏大，
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(3)消化系統反應。 應用氯丙嗪後， 容易引起麻痹性腸梗阻；金黴素、新生黴素、呋喃素、氯丙嗪、苯巴比妥、異煙肼等， 易引起新生兒中毒性肝臟損害。
(4)腎臟損害。 新黴素、慶大黴素、卡那黴素、鏈黴素等對腎臟有一定程度的損害， 應慎用；大劑量應用維生素D， 尤其在腎功能不良時， 很容易引起腎鈣化。
(5)血液變化。 氯黴素可引起新生兒再生性障礙性貧血；碘胺類及水楊酸鹽等易引起血小板減少；伯氨基、磺胺類或大劑量青黴素可引起溶血性貧血；磺胺類、氯丙嗪、對氨基水楊酸、非那西丁等藥物易發生藥源性高鐵血紅蛋白血症。
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(6)智力發育障礙。 長期應用中樞抑制藥， 可能會抑制患兒的學習和記憶能力， 導致智力發育遲緩或障礙， 影響患兒的學習和成長。 目前已知苯二氮卓（如安定）類抗焦慮劑有致遺忘作用；許克銘等對107例癲癇患兒的記憶力進行研究表明， 苯巴比妥、苯妥英鈉和丙戊酸鈉均會影響患兒的記憶能力。
總而言之， 新生兒在很多方面對藥物有特殊要求， 藥物對新生兒也有與成人不完全相同的特殊不良反應， 因此， 必須對藥物的治療作用與不良反應進行全面瞭解， 謹慎使用， 家長切不可隨意給新生兒用藥， 必須要請醫生指導。
