多因素缺陷症多是由多基因錯誤以及有害的環境暴露共同導致。 最常見的多因素缺陷是先天性心肌缺損和開放性神經管缺陷。
到目前為止, 室間隔缺損是最常見的先天性心臟缺損疾病。 室間隔缺損指處於心臟下部的兩個心室的間隔上出現了一個小孔。 如果缺損很小, 一般不需要特別注意, 但如果缺損面積比較大的話, 就需要手術修復了。 再有一種是房間隔缺損, 比較類似於室間隔缺損, 但是缺損出現在心臟上部的心房間隔上。 另一類不是最常見但後果很嚴重的疾病是法洛四聯症,
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開放性神經管缺損是指胎兒的腦、脊髓或者包繞它們的組織發育不正常。 脊柱裂是這類疾病中最常見的一種, 而且一般發生在脊柱下端。 當包繞著損傷的皮膚開放後,
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無腦畸形也是一種開放性神經管缺損類疾病, 是指頭和腦發育不正常。 這種疾病一般導致死胎或者嬰兒出生後立即死亡。
其他多因素缺陷包括幽門狹窄, 這種缺陷是指胃和十二指腸連接部開口閉合;畸形足, 是指足部在踝關節處反向彎曲;唇裂和顎裂, 前者是指唇部出現裂口而後者指口腔上部出現一個洞;先天性髖關節脫臼,