人工流產的併發症有：
術時併發症：子宮出血在200毫升以上；人流綜合征又稱心腦綜合征，
發生率12%，
受術者突然出現心動過緩，
心律失常，
血壓下降，
面色蒼白，
大汗淋漓等一系列症狀，
嚴重者甚至發生昏厥和抽搐；子宮穿孔；漏吸，
胚胎組織未能吸出，
以至妊娠繼續發展。
近期併發症：人工流產不全， 術後陰☆禁☆道出血長達15天以上；術後 2周內由於致病菌的感染而出現子宮內膜炎， 附件炎， 盆腔炎等；宮腔積血；宮腔粘連， 術後閉經或經量顯著減少， 有時伴週期性下腹疼痛或有子宮增大積血。
遠期併發症：慢性盆腔炎；月經異常；繼發不孕；子宮內膜異位症。
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再次妊娠時的併發症：不孕症；晚期流產偏高；早產偏高；圍生期死亡率偏高；產前、產後出血率增加；新生兒溶血症增加。
藥物流產適用於停經49天內的婦女。 國產米非司酮的不全流產和流產失敗率約10%；藥物流產的副作用有噁心， 嘔吐， 頭暈和乏力等類早孕反應， 下腹痛明顯增高；藥物流產後出血時間長， 平均為半個月左右， 有的長達1-2個月之久， 並有潛在大出血的危險；在進行藥物流產中， 部分孕婦停經在40天之內， 此時臨床難以確診是宮外還是宮內妊娠， 因此有時誤診而使用藥物流產， 以後發生內出血休克需要搶救。
藥物流產只能是避孕失敗的補救措施之一， 絕不能以藥物流產當作避孕措施。
