環境因素影響胚胎、胎兒發育的途徑主要是通過母體的呼吸道、消化道及皮膚接觸三條途徑，
使有害環境物質進入母體到達胎兒體內。
通常情況下，
各種環境因素多是經過環境介質(空氣、水、土壤)在日常生活或工作狀態下的接觸而進入人體，
例如污染的空氣和水、污染的食物，
在特殊地質條件下如低碘、高氟也影響水及農作物。
環境污染物通常以低濃度存在，
但可經過食物鏈逐級蓄集而以高濃度進入人體。
不良生活習慣如吸煙、酗酒者則以直接吸入方式攝入有毒物質。
母體感染病毒可傳播給胎兒。
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職業接觸以母親孕期接觸工業化學物質(吸入或皮膚接觸)為多見， 工業化學毒物濃度往往較生活環境中的濃度為高。 職業接觸物理因素如噪聲、電離輻射也可影響胎兒發育。
藥品是典型的直接攝入或接觸（注射）進入母體內再作用于胎兒的。
