甲狀腺激素對孩子智力發育非常重要， 如果甲狀腺激素不足（甲減）， 就會使胎兒腦發育不良， 導致神經系統發育障礙， 嚴重者可發生克汀病（呆小症）。 如果甲狀腺激素過多（甲亢）， 就會使妊娠婦女流產、早產、胎盤早剝等發生率增加， 早產兒、胎兒宮內生長遲緩、足月小樣兒等危險性提高。
胎兒自身甲狀腺在妊娠20周以前尚未形成， 其生長發育需要的甲狀腺激素主要依賴母體， 這個階段是胎兒腦發育的重要時期， 而此階段母體甲狀腺激素缺乏引起的胎兒神經發育損傷又往往無法補救， 因此， 准媽媽們在妊娠早期最好能進行必要的甲狀腺功能檢查：
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一是對於已知有甲減的女性， 一定在甲狀腺功能正常或在足夠甲狀腺激素替代的情況下才能懷孕；二是對於既往有甲狀腺疾病或有家族史， 或生活在碘缺乏地區的女性妊娠8周內應篩查血清促甲狀腺激素（TSH）和甲狀腺激素水準， 一旦不足， 應儘快補充甲狀腺激素；三是所有的女性妊娠後最好篩查血清促甲狀腺激素（TSH）和甲狀腺激素。
患甲亢的孕婦自發性流產幾率比正常人高兩倍左右， 建議患甲亢的女性控制病情後再準備懷孕。 一旦妊娠後才發現病症且比較嚴重， 最好在胎兒4-6個月內手術切除甲狀腺。
