病原菌為志賀菌屬， 通稱為痢疾桿菌， 革蘭染色陰性， 是需氧性桿菌， 無莢膜， 無鞭毛， 不活動， 長約1～3μm。 細菌對外界抵抗力強， 能耐寒、耐潮濕， 在低溫及潮濕的地方可長時間生存， 在室溫下， 在蔬菜、食品上能存活1~2周， 但在日光照射下半小時即可死亡， 在加熱到100℃可立即死亡。 對酸性物及很多化學藥品、消毒劑如新潔爾滅（苯紮溴銨）， 漂白粉（含氯石灰）， 過氧乙酸、甲酚（來蘇兒）等均很敏感。 故可以採用日光照射、煮沸、及消毒劑來殺滅痢疾桿菌。
痢疾桿菌在分類學上屬腸桿菌科志賀菌屬(Shige -lla)。 志賀菌屬分為志賀痢疾桿菌、福氏痢疾桿菌、鮑氏痢疾桿菌、宋內痢疾桿菌四個群，
Advertisiment
痢疾各群及各血清型之間無交叉免疫， 所以痢疾可反復發病， 且在不同時期、不同地區流行的菌群也不同， 故痢疾可反復發生流行、不易控制。
各型痢疾桿菌都可產生內毒素， 即存在於痢疾桿菌胞壁上的一種脂多糖， 細菌侵入人體後， 菌體裂解即釋放出來， 即引起人體發生全身反應如發熱、產生毒血症、休克及大腸黏膜血管收縮， 引起腸黏膜缺血、缺氧、壞死與潰瘍等。 痢疾桿菌除能產生內毒素外， 也可產生外毒素， 其中以志賀痢疾桿菌產生外毒素的能力最強， 它是毒力很強的可溶性腸毒素。 外毒素具有以下作用：①神經毒作用：家兔注射後，
Advertisiment
近年來還發現痢疾桿菌可影響腸道內膽鹽對脂肪的消化過程導致脂肪瀉。 細菌還可促使腸道內的脂肪酸羥化， 生成蓖麻酸樣物質。 引起水瀉， 所以在臨床上可見痢疾早期也可以是水樣便、脂肪樣不消化便， 後期再變成膿血便。
