其實試管嬰兒和正常妊娠所生的孩子一樣, 出現某些畸形也是完全可能的, 但出現畸形的危險性很小。 很多不育夫婦在做試管嬰兒前, 會一再要求醫生做出承諾, 這未免有點苛求。 試管嬰兒發生畸形的比例和自然懷孕相同。 一般來說, 35歲以上為高齡孕產婦, 胎兒的流產率和畸形率都比年輕的女性要高。
不過, 攜帶異常遺傳基因的夫妻, 確實存在將自己的異常遺傳給後代的可能性,
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另外, 子宮本身具有將異常胚胎流產的能力, 臨床還可以利用現代科技對胚胎和胎兒進行全面檢查, 早期淘汰異常或畸形兒。 最後, 在萬不得已的情況下, 通過產前診斷來明確胎兒的發育情況, 對於明確診斷有嚴重問題的胚胎, 可以通過有效的處理手段淘汰掉。
因此不孕不育夫妻是無需擔心這個問題的, 而因素自然懷孕出現胎兒畸形情況, 那麼做試管嬰兒也是可能的, 試管嬰兒是無法避免胎兒畸形現象的, 想通過試管嬰兒避免畸形是不可能的, 試管嬰兒只是助孕而不能起到治療的效果。