病兒住院後, 醫生根據病兒體重、有無肺炎、有無合併畸形等情況做‘病情危重度’分組, A組病情相對較輕, B組較重, C組嚴重同時預後最差。 治療包括四個階段:
第一階段為術前準備, 一般在住院後數小時完成, 包括禁食、吸引口腔及近端食管內粘液、保溫、保濕、腸外營養支持等。 有人主張靜脈使用甲腈咪呱, 以降低胃液酸度, 並持續用至吻合口癒合為止。 嚴格的呼吸管理應儘早開始, 這是手術成敗的重要條件之一。 內容有①專人護理, 最好單間隔離, 預防交叉感染。 平或側臥位定時翻身、拍背和吸痰。 分泌物送細菌培養及藥敏試驗;②反復進行血液氣體分析以監測呼吸功能;③恰當地應用呼吸治療方法,
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第二階段為手術, 根據類型、病情危重度、醫院技術設備條件決定手術方法, 包括一期吻合術和分期手術。 常見的Ⅲ型一般經右側後外側開胸實施一期吻合術, 在胸膜外行食管端端吻合和食管氣管瘺的斷閉術。 此階段是治療關鍵。
第三階段為術後監護, 一般為術後3—5天。 管理同術前準備階段內容,
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第四階段為恢復期, 一般術後第4—6天經食管造影證實吻合口完全癒合後可以餵奶。 術後早期(1—14天左右)食管狹窄(一般在食管吻合口處)時, 可開始擴張食管或局部注射激素。 術後7天拆線, 如果傷口癒合好, 體溫、呼吸、脈搏正常, 經口餵奶能維持營養, 無嘔吐嗆奶, 即可以出院。 並定期隨診。