從大的分類來講，
先天性心臟病手術分為閉合式手術及體外迴圈下心臟直視手術。
閉合式手術用於動脈導管未閉結紮術、主動脈縮窄成形術等。
在胸外側切口術中，
患者心臟、肺仍執行各自的功能。
體外迴圈下心臟直視手術又稱心臟開放手術，
為最常採用的方法，
胸正中切口，
劈開胸骨，
術中使用體外迴圈機代替心、肺功能，
將心臟停止跳動，
修補後再複跳，
恢復心、肺功能。
如室間隔缺損修補術、房間隔缺損修補術、法樂氏四聯症根治等等，
目前尚有在體外迴圈機輔助下，
保持心臟仍跳動下進行手術，
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如房間隔缺損修補術等，
更有利於手術後心肌創傷恢復。
除了心內缺損修補、瓣膜成形等手術外，
對於複雜先天性心臟病尚有各種特殊的術式，
往往以發明者的名字命名。
如Rastelli手術，
Fontan手術等等，
以解決右室雙出口、單心室、三尖瓣閉鎖等複雜先天畸形的矯治。
先天性心臟病的手術最佳時間是一個最簡單回答，
又最難回答的問題。
一般來講，
從患兒適應手術能力，
配合術後治療，
不影響學習等方面來考慮，
以3－6歲為最佳，
但一定結合具體疾病、病人具體的情況決定。
有些先天性心臟病必須早期手術，
否則失掉良好的手術機會，
如大的室間隔缺損、動脈導管未閉，
由於大量左向右分流，
嬰兒期反復肺部感染伴心力衰竭，
單純藥物治療難以控制，
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往往伴重度肺動脈高壓，
因此應及早完成手術，
一般l歲以內，
甚至小於半歲。
但是2歲以內的中小室間隔缺損，
如果臨床無症狀，
心電圖影響不大，
生長發育正常，
可等到2歲複查以後再決定手術，
因大約30％—40％的膜部、肌都室間隔缺損可以隨年齡增長自然閉合。
雖然目前的心臟手術技術及設備、體外迴圈、麻醉水準都己很高，
但畢竟存在不少的併發症，
甚至危及生命，
而且年齡越小，
難度越大，
因此對身體生長發育及心臟影響較小的先天性心臟病如房間隔缺損、小的室間隔缺損及動脈導管未閉最好等到較大年齡手術為宜。
法樂氏四聯症手術最掛年齡3－6歲，
但如有缺氧發作發生，
便無年齡限制。
青紫特別嚴重、肺動脈條件極差者，
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亦可考慮先做主動脈—肺動脈轉流手術，
以提供較充分的肺血流，
促進肺血管發育，
然後1－2年內完成根治手術。
